V ľudskom tele sa našiel super-rozšírený vírus, o ktorom sme doteraz nevedeli

Vedci práve oznámili objav nového, neuveriteľne bežného vírusu, ktorý žije v ľudských črevných baktériách. Nazýva sa "crAssphage" a je takmer šesťkrát bežnejší ako všetky ostatné bakteriálne vírusy. Ale ako sme si ho tak dlho nevšimli?

Dôvod, prečo sme predtým nenašli crAssphage je, že sme nevedeli, že by sme to mali hľadať. To to znamená.

Hoci nové technológie sekvencovania sa stávajú rýchlejšími a lacnejšími, stále majú jednu slabosť: sú dobré pri hľadaní vecí, o ktorých už vieme, ale nie sú dobré na hľadanie nových organizmov. Keď výskumníci študujú organickú vzorku, dostanú polievku z DNA fragmentov všetkých živých vecí súvisiacich s touto vzorkou - baktérie, vírusy a samotnú osobu. Tieto fragmenty je potrebné zostaviť do sekvencií, ktoré môžeme identifikovať. Ak nájdeme reťazec špecifický pre genóm určitej baktérie, znamená to, že sme túto baktériu našli vo vzorke..

Problém je v tom, že ak ešte nepoznáme postupnosť vírusu, ktorý je nám neznámy, nemôžeme ho pomocou tejto techniky zistiť. V skutočnosti, autor novej štúdie crAssphage, Bass Datil, uvádza, že nie sú známe takmer 75% sekvencií DNA vo vzorkách, ktoré študovali..

Tím Datila dokázal nájsť nový vírus pomocou úplne odlišného prístupu založeného na jednoduchej myšlienke: fragmenty, ktoré sa znovu a znovu nachádzajú v tej istej vzorke, sú častejšie súčasťou toho istého genómu. Použili techniku ​​tzv. Cross-assembly na identifikáciu takejto skupiny opakovaných sekvencií vo vzorkách odobratých od 12 ľudí. Tieto sekvencie potom zostavili do jediného genómu..

A dostali presne to: crAssphage vírus, pomenovaný podľa techniky krížovej montáže, ktorá viedla k jeho objaveniu. Zistili, že crAssphage žije v Bacteroides - spoločnej skupine baktérií, ktoré žijú v našich črevách..

Ako výsledok výskumu, tím našiel crAssphage v 75% črevných sekvencií ľudí v USA, Európe a Južnej Kórei. Ešte nevieme, čo presne tieto fágy v našich črevách robia, ale určite hrajú určitú úlohu v našom črevnom mikrobiálnom ekosystéme..

A nakoniec, zaujímavý fakt: vedci vypočítali, že v našom tele je približne 100-krát viac vírusových častíc ako v skutočnosti ľudské bunky. Takže máme ešte veľa práce, aby sme zistili, čo skutočne sme..